4月3日,中国农业科学院三亚国家南繁研究院副院长、作物所基因与分子设计中心副主任李慧慧到舜丰生物考察交流,并作《从育种家公式到智慧育种》的精彩分享。
李慧慧老师自2005年以来一直致力于作物数量遗传学研究,围绕数量性状遗传解析方法及育种应用研制了系列方法和软件工具,在国内外多个科研及育种单位广泛应用。
本次分享中,李老师介绍了利用植物海量多组学数据研发的全基因组预测的深度学习新方法Deep Neural Network for Genomic Prediction(DNNGP),该方法可以利用多组学数据开展全基因组预测。通过应用案例,李老师向我们展示了DNNGP稳健的预测精度,不仅在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显。
同时,与已有深度学习方法相比,DNNGP的超参数调整更加用户友好,可针对具有复杂结构的海量数据进行高效数学建模,实现了育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。
目前,人工智能、大数据、基因编辑、表型组学等技术正在蓬勃发展,现代农业已步入数字农业时代。种业数据库的建立、大数据分析、模型预测等新技术新方法将大大加强作物数据多维分析与鉴定的精度与速度,推动“经验育种”向“精确育种”转变。座谈会上,双方针对如何将基因编辑育种与全基因组预测有机结合展开了深入交流,共同讨论加速实现以基因编辑技术为核心的定制设计育种方式。
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